海口藥品監(jiān)督管理局是2002年1月成立的政府行政執(zhí)法部門(mén)，2004年更名為海口食品藥品監(jiān)督管理局，屬省食品藥品監(jiān)督管理局和市委市政府雙重管理。承擔(dān)對(duì)藥品（醫(yī)療器械）研制、生產(chǎn)、流通、使用全過(guò)程監(jiān)管職能；核發(fā)藥品零售企業(yè)經(jīng)營(yíng)許可證，核發(fā)醫(yī)療器械零售企業(yè)經(jīng)營(yíng)許可證，市級(jí)新聞媒體藥品廣告監(jiān)管，藥品零售企業(yè)信息統(tǒng)計(jì)，藥品零售企業(yè)業(yè)務(wù)培訓(xùn)，零售企業(yè)的非處方藥、特殊藥品、醫(yī)療器械管理，藥品不良反應(yīng)監(jiān)測(cè)，受理投訴，日常監(jiān)督檢查與執(zhí)法，查處藥品和醫(yī)療器械違法行為以及上級(jí)交辦的其它任務(wù)。
    2004年，市政府同時(shí)成立了海口市食品協(xié)調(diào)委員會(huì)，下設(shè)辦公室在我局，并從我局抽調(diào)人員負(fù)責(zé)該辦公室日常工作。主要承擔(dān)食品綜合監(jiān)督、組織協(xié)調(diào)和依法組織開(kāi)展查處重大食品事故職能，但不代替農(nóng)業(yè)、質(zhì)監(jiān)、工商、衛(wèi)生等食品監(jiān)管環(huán)節(jié)執(zhí)法，是市委、市政府食品工作的“總抓手”和“參謀部”。
    按照省、市機(jī)構(gòu)改革方案要求，2009年11月份，我局由省食品藥品監(jiān)督管理局垂直管理單位改制為市政府管理的政府工作部門(mén)，職責(zé)是在繼續(xù)行使藥品監(jiān)管職能的基礎(chǔ)上，增加對(duì)餐飲業(yè)、食堂等餐飲服務(wù)環(huán)節(jié)的食品行政許可和監(jiān)督管理職責(zé)和保健食品、化妝品行政許可及監(jiān)督管理。